nsu_bionet_mebocharnikova_202306.pdf

• Бочарникова Мария Евгеньевна, ММФ НГУ (гр. 21152), ИЦиГ СО РАН
• Афонников Дмитрий Аркадьевич, к.б.н., в.н.с. ИЦиГ СО РАН

Геномы живых организмов содержат десятки тысяч генов, кодирующих белки. Каждый белок экспрессируется в результате транскрипции и трансляции и принимает уникальную трехмерную структуру, которая, как правило, состоит из нескольких функциональных доменов. Каждый домен отвечает за специфические взаимодействия с лигандами и обуславливает функцию белка.

Функции белка определяются комбинацией доменов, один из которых, как правило, является основным (ферментативным).

Биологов интересует распознавание функций белков, кодируемых в геномах. Поскольку количество генов велико, то решение такой задачи связано с необходимостью вычислительной обработки больших геномных данных.

Главной целью работы является создание автоматического вычислительного конвейера для поиска и анализа белков-ортологов в геномах групп организмов. Данный конвейер может использоваться молекулярными биологами и биоинформатиками для более точного анализа многодоменных белков в геномах немодельных организмов.

Работа поддержана «Курчатовским геномным центром ИЦиГ СО РАН», проект № 075-15-2019-1662

• Турнаев И. И., Бочарникова М. Е., Афонников Д. А. Фосфолипазы A2 человека: функциональный и эволюционный анализ //Вавиловский журнал генетики и селекции. – 2023. – Т. 26. – №. 8. – С. 787-797.