nsu_dkkulikova_202307.pdf

• Куликова Дарья Константиновна, Механико-математический факультет НГУ, кафедра Дискретной математики и информатики, 4-й курс, группа 19133
• Вишневский Олег Владимирович, к.б.н., н.с. ИЦиГ СО РАН, научный руководитель.

Работа посвящена разработке метода, позволяющего найти точную оценку вероятности наблюдения заданного IUPAC мотива по случайным причинам в последовательности нуклеотидов заданной длины. В ходе работы разработаны методы, основанные на различных подходах и имеющие разные области применения. Для каждого метода написана компьютерная программа, отличающаяся от других по скорости счёта и области применения. Среди полученных программ имеются следующие программы:

• Программа для нахождения точной оценки вероятности наблюдения заданного IUPAC мотива по случайным причинам в последовательности нуклеотидов заданной длины в прямой или обратной цепях ДНК с низкой скоростью вычислений.
• Программа для нахождения точной оценки вероятности наблюдения заданного IUPAC мотива по случайным причинам в последовательности нуклеотидов заданной длины в прямой цепи ДНК с более высокой скоростью вычислений, в сравнении с первой программой.

С помощью первой программы была оценена доля и выявлены типы мотивов для которых показаны наибольшие отклонения оценки вероятности согласно аппроксимационной формуле.

• Куликова Д.К. Уточненная оценка вероятности наблюдения заданного IUPAC мотива по случайным причинам в последовательности нуклеотидов заданной длины//Биология: Материалы 61-й Междунар. науч. студ. конф. 17–26 апреля 2023 г. / Новосиб. гос. ун-т. — Новосибирск : ИПЦ НГУ, 2023 (Принято в печать).