"Поиск генов устойчивости картофеля к золотистой картофельной нематоде с помощью технологии RNA-seq". Николай Александрович Шмаков, аспирантура ИЦиГ СО РАН, 20.6.2019
bionet_nashmakov_201906_rsf-potato.pdf
Работа поддержана грантом РНФ 16–16-04073 «Генетические маркеры хозяйственно-ценных признаков картофеля».
Состав коллектива
- Шмаков Николай Александрович, аспирант ИЦиГ СО РАН
- Афонников Д. А., зав.лаб. ИЦиГ СО РАН, к.б.н.
- Кочетов Алексей Владимирович, зав.лаб. ИЦиГ СО РАН, д.б.н.
- Егорова Анастасия Александровна, магистрант
Аннотация
'Картофель (Solanum tuberosum) – одна из важнейших сельскохозяйственных культур. Огромный ущерб урожаям картофеля причиняет золотистая картофельная нематода (Globodera rostochiensis). Существуют линии картофеля с повышенной устойчивостью к ЗКН, но конкретные генетические механизмы этой устойчивости до конца не известны. Семейство генов NBS-LRR участвует в создании растительного иммунитета. В данной работе был проведён эксперимент RNA-seq для исследования транскриптомов устойчивой к ЗКН и уязвимой к ЗКН линий картофеля. Была установлена дифференциальная экспрессия ряда генов семейства NBS-LRR, и были обнаружены гены семейства NBS-LRR, представленные в устойчивой к ЗКН линии, но не в уязвимой линии.'
Публикации
- Kochetov, Alex V et al. “Differential expression of NBS-LRR-encoding genes in the root transcriptomes of two Solanum phureja genotypes with contrasting resistance to Globodera rostochiensis.”BMC plant biology vol. 17,Suppl 2 251. 28 Dec. 2017, doi:10.1186/s12870-017-1193-1