bionet_nashmakov_201906_phd-thesis.pdf

Работа поддержана грантами РФФИ 16-34-00924 и РНФ 16-14-00086

• Шмаков Николай Александрович, аспирант ИЦиГ СО РАН
• Афонников Дмитрий Аркадьевич, зав лаб ИЦиГ СО РАН, к.б.н.
• Хлёсткина Елена Константиновна, зав лаб ИЦиГ СО РАН, д.б.н.
• Васильев Георгий Владимирович, с.н.с, к.б.н.
• Глаголева Анастасия Юрьевна, магистрант НГУ

'Растительные пигменты, такие как хлорофилл и фитомеланины, играют важнейшие роли в жизни растений и имеют большое сельскохозяйственное значение. Для изучения генетических механизмов появления аномальных типов окраски растений, связанных с такими растительными пигментами, как хлорофилл и фитомеланины, использованы почти изогенные линии ячменя, несущие мутантные аллели генов Blp и Alm. Для исследования изменений в транскриптоме растения, связанных со специфической окраской, была использована технология RNA-seq, и компьютерный анализ был проведён на ресурсах ИВЦ НГУ. Было установлено, что меланизм колоса у ячменя связан с активацией генов, входящих в пути биосинтеза флавонолов и жирных кислот, в то время как альбинизм колоса связан с деактивацией генов, связанных с биосинтезом хлорофилла и фотосинтезом.'

• Glagoleva AY, Shmakov NA, Shoeva OY, Vasiliev GV, Shatskaya NV, Börner A, Afonnikov DA, Khlestkina EK. Metabolic pathways and genes identified by RNA-seq analysis of barley near-isogenic lines differing by allelic state of the Black lemma and pericarp (Blp) gene // BMC Plant Biology. 2017; 17(Suppl 1):182. doi: 10.1186/s12870-017-1124-1
• Shmakov NA, Vasyliev GV, Shatskaya NV, Doroshkov AV, Gordeeva EI, Afonnikov DA, Khlestkina EK. Identification of nuclear genes controlling chlorophyll synthesis in barley by RNA-seq // BMC Plant Biology. 2016; 16 (Suppl 3) :245. doi: 10.1186/s12870-016-0926-x