"Моделирование природных полиморфизмов ДНК-полимеразы β человека". Тимофей Евгеньевич Тюгашев, ИХБФМ СО РАН, 30.5.2025
Состав коллектива
- Кладова Ольга Алексеевна, к.х.н., м.н.с., ИХБФМ СО РАН, руководитель;
- Тюгашев Тимофей Евгеньевич, в. инж., ИХБФМ СО РАН, исполнитель.
Аннотация
С помощью молекулярно-динамического моделирования в программном пакете GROMACS проведено исследование ДНК-полимеразы β человека дикого типа и ряда мутантных форм: L19P, G66R, G274R, G290C и R333W. Эти мутации являются результатом однонуклеотидных полиморфизмов гена данного фермента и ассоциированы с различными заболеваниями. Анализ структуры апофермента и комплексов фермента с субстратами позволил, в сочетании с экспериментальными данными, предположить функциональные эффекты, вызываемыми указанными аминокислотными заменами.
Финансовая поддержка
Грант РНФ №21-74-10103 «Роль природных полиморфизмов ДНК-полимеразы β в процессе эксцизионной репарации оснований», Кладова О.А. 2021-2023
Публикации
- Kladova, O.A., Tyugashev, T.E., Yakimov, D.V., Mikushina, E.S., Novopashina, D.S., Kuznetsov, N.A. & Kuznetsova, A.A. The Impact of SNP-Induced Amino Acid Substitutions L19P and G66R in the dRP-Lyase Domain of Human DNA Polymerase β on Enzyme Activities. International Journal of Molecular Sciences. 2024;25(8):4182. DOI: 10.3390/ijms25084182 IF:4.9
- Kladova, O.A., Tyugashev, T.E., Miroshnikov, A.A., Novopashina, D.S., Kuznetsov, N.A. & Kuznetsova, A.A. SNP-Associated Substitutions of Amino Acid Residues in the dNTP Selection Subdomain Decrease Polβ Polymerase Activity. Biomolecules. 2024;14(5):547. DOI: 10.3390/biom14050547 IF: 4.8