"Сборка и анализ генома человека". Юрий Викторович Вяткин, 27.12.2018
Состав коллектива
- Штокало Дмитрий Николаевич, ИСИ СО РАН, н.с., к.ф.-м.н.
- Вяткин Юрий Викторович, ООО «АкадемДжин», биоинформатик, руководитель проектов
- Антонец Денис Викторович, ФГУН ГНЦ ВБ «Вектор» Роспотребнадзора, с.н.с., к.б.н.
- Кабилов Марсель Расимович, ИХБФМ СО РАН, руководитель ЦКП «Геномика» СО РАН, к.б.н.
Аннотация
Проект направлен на изучение сборки геномов автохтонных народов Сибири по данным секвенирования ДНК, полученных на приборах секвенирвания второго и третьего поколения, с помощью существующих методов. Получаемые сборки геномов сравниваются с существующими референсными геномами и между собой. Кроме того, задача предполагает получение из данных секвенирования ДНК дополнительных сведений, таких как состав однонуклеотидных и структурных (протяженных) вариаций по отношению к референсному геному и последующий филогенетический анализ полученных геномов существующими методами. Проводится анализ вариаций геномов существующими и оригинальными методами.