, , , ,

"Анализ филогенетических отношений в роде Горох (Pisum L.)". Вера Сергеевна Богданова, ИЦиГ СО РАН, 13.9.2022

bionet_vsbogdanova_202209.pdf

Состав коллектива

  • Костерин Олег Энгельсович, д.б.н., зав. лабораторией, Институт Цитологии и генетики СО РАН, доцент кафедры цитологии и генетики ФЕН НГУ;
  • Богданова Вера Сергеевна, д.б.н., с.н.с., Институт Цитологии и генетики СО РАН;
  • Соловьев Владимир Игоревич, ст. преподаватель НГУ

Аннотация

В настоящей работе проведена сборка геномов клеточных органелл, пластид и митохондрий, исходя из данных высокопроизводительного секвенирования ДНК, у 26 образцов гороха (род Pisum) в результате чего анализируемая выборка была расширена до 64 образцов.. Проведен филогенетический анализ реконструированных нуклеотидных последовательностей, построены филогенетические деревья полных пластидных геномов и полных митохондриальных геномов. Филогенетическое дерево, построенное на основе пластидных геномов, значительно отличалось от дерева, построенного на основе митохондриальных геномов. Полученные результаты свидетельствуют о том, что в ходе эволюции гороха клеточные органеллы наследовались дискордантно. У одного образца, происходящего из Турции, был обнаружен митохондриальный геном, несущий вставку около 13 тыс. нуклеотидов, характерную для отдаленных представителей рода, что свидетельствует о рекомбинации между митохондриальными геномами. Кроме того, сборка нуклеотидной последовательности ранее неидентифицированного ядерного гена у 20 образцов из публичных баз данных позволила идентифицировать последовательность из референсного генома гороха как ген альбумина семядолей, являющийся удобным маркером для филогенетических исследований.

Источники финансирования

  • Гос. задание 0259-2021-0012 (2021)
  • Бюджетный проект FWNR-2022-0017 (2022)

Публикации

  • Bogdanova VS, Shatskaya NV, Mglinets AV, Kosterin OE, Vasiliev GV. Discordant evolution of organellar genomes in peas (Pisum L.) Mol Phylogenet Evol. 2021 Jul;160:107136. DOI: 10.1016/j.ympev.2021.107136 (Импакт-фактор 4.286)
  • Mglinets AV, Bogdanova VS, Kosterin OE. Identification of the gene coding for seed cotyledon albumin SCA in the pea (Pisum L.) genome. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2022;26(4):359-364; DOI: 10.18699/VJGB-22-43 (РИНЦ - 1,020; Web of Science - 0,15)