bionet_vsbogdanova_visolovyev_202009.pdf

Работа поддержана грантом РФФИ № 19-04-00162\19 А «Роль гибридизации и сопряженного с ней конфликта ядра и цитоплазмы в формировании паттернов эволюции геномов клеточных органелл в роде горох (Pisum L.).», руководитель - Костерин Олег Энгельсович (2019-2020).

Состав коллектива

  • Костерин Олег Энгельсович, д.б.н., зав. лабораторией, Институт Цитологии и генетики СО РАН, доцент кафедры цитологии и генетики ФЕН НГУ;
  • Богданова Вера Сергеевна, д.б.н., с.н.с., Институт Цитологии и генетики СО РАН;
  • Мглинец Анатолий Васильевич, к.б.н., с.н.с., Институт Цитологии и генетики СО РАН;
  • Соловьев Владимир Игоревич, ст. преподаватель НГУ, м.н.с., Институт Цитологии и генетики СО РАН;

Аннотация

В настоящей работе проведена сборка геномов клеточных органелл, пластид и митохондрий, у 38 образцов гороха (род Pisum) и эндемичного бобового растения Vavilovia formosa, исходя из данных высокопроизводительного секвенирования ДНК. Проведен филогенетический анализ реконструированных нуклеотидных последовательностей, построены филогенетические деревья полных пластидных геномов, полных митохондриальных геномов и одного ядерного гена. Сравнительный анализ показал, что филогенетическое дерево, построенное на основе пластидных геномов в целом соответствует дереву, построенному на основе последовательностей ядерного гена, но значительно отличается от дерева, построенного на основе последовательностей митохондриальных геномов. Полученные результаты свидетельствуют о том, что в ходе эволюции гороха клеточные органеллы наследовались дискордантно, по-видимому, за счет неканонического двуродительского наследования пластид, происходящего вследствие ядерно-цитоплазматического конфликта.

Публикации

  • Bogdanova, V.S., Mglinets, A.V., Shatskaya, N.V., Kosterin, O.E., Solovyev, V.I., Vasiliev, G.V. 2018. Cryptic divergences in the genus Pisum L. (peas), as revealed by phylogenetic analysis of plastid genomes. Mol. Phyl. Evol. 129, 280-290. (Импакт-фактор 3,29) https://doi.org/10.1016/j.ympev.2018.09.002
  • Shatskaya, N.V., Bogdanova, V.S., Kosterin, O.E., Vasiliev, G.V., Kimeklis, A.K., Andronov, E.E., Provorov, N.A. 2019. The plastid and mitochondrial genomes of Vavilovia formosa (Stev.) Fed. and the phylogeny of related legume genera. Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii = Vavilov Journal of Genetics and Breeding 23 (8), 972-980. (РИНЦ 0,858; Scopus 0,5) https://doi.org/10.18699/VJ19.574.