"Моделирование природных полиморфизмов ДНК-полимеразы β человека". Тимофей Евгеньевич Тюгашев, ИХБФМ СО РАН, 31.5.2023
Состав коллектива
- Кладова Ольга Алексеевна, к.х.н., м.н.с., ИХБФМ СО РАН, руководитель;
- Тюгашев Тимофей Евгеньевич, в. инж., ИХБФМ СО РАН, исполнитель.
Аннотация
Посредством молекулярно-динамических расчетов в программном пакете GROMACS было выполнено моделирование ДНК-полимеразы β человека дикого типа и мутантных форм G118V, R149I, E154A, G189D, M236T и R254I, являющихся продуктами однонуклеотидных природных полиморфизмов гена этого фермента, ассоциированных с различными заболеваниями. Результаты моделирования структуры апофермента и фермент-субстратного комплекса, позволяют, вместе с экспериментальными результатами, предположить эффекты, вызываемые соответствующими модификациями белка.
Грантовая поддержка
- РНФ № 21-74-10103 «Роль природных полиморфизмов ДНК-полимеразы β в процессе эксцизионной репарации оснований», Кладова О.А. 2021-2023
Публикации
- Kladova O.A. et al. The Activity of Natural Polymorphic Variants of Human DNA Polymerase β Having an Amino Acid Substitution in the Transferase Domain: 9 // Cells. Multidisciplinary Digital Publishing Institute, 2023. Vol. 12, № 9. P. 1300. DOI: 10.3390/ijms24065892 IF 6.208
- Kladova O.A. et al. Human Polβ Natural Polymorphic Variants G118V and R149I Affects Substate Binding and Catalysis: 6 // International Journal of Molecular Sciences. Multidisciplinary Digital Publishing Institute, 2023. Vol. 24, № 6. P. 5892. DOI: 10.3390/cells12091300 IF 7.666