"Структурное моделирования сигнального комплекса, индуцирующего программируемую клеточную гибель". Никита Владимирович Иванисенко, ИЦиГ СО РАН, НГУ, 24.1.2020
Состав коллектива
- Иванисенко Никита Владимирович, м.н.с., НГУ, ФИЦ ИЦиГ СО РАН
Аннотация
С использованием методов структурного моделирования была предсказана структура филаментов, состоящих из эффекторных доменов смерти (DED) белков c-FLIP, прокаспаза-8 и FADD. Для этого была проведена сравнительная оценка энергии взаимодействия всех комбинаций интерфейсов эффекторных доменов смерти белков c-FLIP и каспаза-8 с FADD с использованием методов белок-белок докинга высокого разрешения. В результате было предсказано наличие селективных сайтов связывания c-FLIP и каспазы-8 с FADD, а так же получена модель FADD платформы, инициирующей рост DED филамента. Предсказанная модель имела хорошее согласие с экспериментальными данными и позволила предположить новую роль белка c-FLIP в регуляции сборки комплекса DISC.
Публикации
- Hillert LK, Ivanisenko NV, Espe J, König C, Ivanisenko VA, Kähne T, Lavrik IN. Long and short isoforms of c-FLIP act as control checkpoints of DED filament assembly. Oncogene. 2019 Nov 18:1-7. (Импакт фактор 6.634)