"Моделирование in silico эффекта от введения мутаций в антиген-связывающую область антитела против вируса клещевого энцефалита". Иван Константинович Байков, ИХБФМ СО РАН, 28.10.2022
Состав коллектива
- Байков Иван Константинович, к.х.н., с.н.с. ИХБФМ СО РАН, ассистент преподавателя кафедры ХТТ ФЕН НГУ
- Михайлова Екатерина Евгеньевна, бакалавриат ФЕН НГУ
Аннотация
Данное исследование направлено на создание мутантных вариантов протективного антитела против вируса клещевого энцефалита, которые бы обладали повышенной эффективностью по отношению к штаммам Европейского и Сибирского субтипов ВКЭ. Для этого были использованы методы рационального дизайна белковых молекул в комбинации с классическими методами генетической и белковой инженерии. За отчетный период была исследована возможность стабилизации комплекса «антитело-антиген» за счет введения мутаций, приводящих к формированию дополнительных ионных связей («солевых мостиков») между белковыми молекулами. Моделирование in silico показало стабильность образующихся связей, однако экспериментальная проверка на рекомбинантных белках показала отсутствие повышения аффинности таких вариантов антитела к вирусному белку.
Доклады
- Устный доклад «Структурный дизайн антитела против вируса клещевого энцефалита с целью расширения его специфичности» на Школе молодых ученых «Применение синхротронного излучения для рещения задач биологии» (11-13 мая 2022 г, г. Новосибирск).
- Устный доклад «Структурный дизайн антитела против вируса клещевого энцефалита с целью расширения его специфичности» на школе-конференции "Геномные технологии в получении вирус-нейтрализующих антител" (09 сентября 2022).