kinetics_avkim_201204.pdf

• Ким Александра Валерьевна, ИХКГ СО РАН

'Рассчитать свободную энергию Гиббса гидрофобного взаимодействия между молекулами С₈Е₆ и водой. Использовать метод термодинамического интегрирования и метод Беннетта, реализованный в пакете программ молекулярно-динамического моделирования Gromacs 4.5. Провести расчёты для температур 250К, 260, … 400 К. Установить или опровергнуть корреляцию температурных зависимостей гидрофобности С₈Е₆ с волюметрической характеристикой одиночной гидратированной молекулы С8Е6 - вкладом воды в кажущийся объём (уже рассчитан). А также проверить, совпадает ли рассчитанная температура смены знака гидрофобности С₈Е₆ с эксперименальной точкой помутнения водного раствора С₈Е₆.'

Расчёты на кластере стартовали в конце 2011г. На данный момент по полученным результатам планируется публикация статьи, поданы тезисы на следующие конференции:

• “Molecular association in fluid phases and at fluid interfaces” EMLG/JMLG Annual Meeting 2012, 5-9 September, Eger, Hungary. Kim A.V., Medvedev N.N., Anikeenko A.V., Geiger A. “Volumetric and thermodynamic properties of hexaethylene glycol monoocthyl ether (С₈Е₆) in water solution”
• VIII Voevodsky international conference “Physics and chemistry of elementary chemical processes” (VVV-2012). Novosibirsk, July15-19, 2012. Kim A.V., Medvedev N.N. “Volumetric indicator of the hydrophobic/hydrophilic balance of the amphiphilic molecule С₈Е₆. MD simulation”
• XIX Всероссийская конференция “Структура и динамика молекулярных систем” Яльчик - 2012. Медведев Н.Н., Ким А.В., «»
• The 9-th International Symposium on Voronoi Diagrams in Science and Engineering (ISVD 2012), 27-29 June, Rutgers University, New Jersey, USA. Medvedev N.N., Voloshin V.P., Anikeenko A.V., Kim A.V. “Voronoi shells and Delaunay simplexes”