nsu_asursul_201701.pdf

• Урсул Алексей Сергеевич, студент МедФ НГУ 4 курса – программист, исполнитель.
• Бакулина Анастасия Юрьевна, к.б.н., зав.лабораторией структурной биоинформатики и молекулярного моделирования кафедры молекулярной биологии ФЕН НГУ – научный руководитель.

'На основе рассчитанных траекторий сворачивания белка виллина методами молекулярной динамики с образованием стабильных третичных структур, выполненных на суперкомпьютере НГУ, планируется провести анализ полученных состояний белка, и на основе сравнения по гомологии с третичными структурами известных белков из RCSB PDB (Protein Data Base) проверить метод поиска нативной структуры белка по его околонативному состоянию с использованием обширной базы гомологов. В рамках работы планируется выявить, имеется ли корреляция (и если да, то в какой степени) между первичной структурой белка (его аминокислотной последовательностью) и его полученной околонативной формой – промежуточной третичной формой, конфигурацию которой можно рассчитать на современных суперкомпьютерах.'