"Восстановление петель хроматина экспрессией экзогенного белка CTCF". Артем Рустамович Нурисламов, магистратура НГУ, 30.6.2024
Состав коллектива
- Нурисламов Артем Рустамович, студент ФЕН НГУ, гр.22425
- Фишман Вениамин Семенович, к.б.н., в.н.с. ФИЦ ИЦиГ СО РАН, научный руководитель
Аннотация
Пространственная организация геномов эукариот, включающая топологически-ассоциированные домены (ТАДы) и компартменты, консервативна, но механизмы их формирования могут различаться. У позвоночных одним из таких механизмов является экструзия петель хроматина с участием когезинового комплекса и белка-инсулятора CTCF. Однако у дрозофил, несмотря на наличие всех компонентов экструзионного комплекса, этот механизм отсутствует. В данном исследовании проведен эволюционный анализ структуры CTCF, выявивший разное время происхождения функциональных аминокислотных мотивов, и отобраны виды для экспериментов: мышь, курица, рыбка данио, дрозофила, скат, минога и ланцетник. Экспрессия CTCF мыши и курицы в клетках человека с деградированным эндогенным CTCF показала, что данные ортологи белка восстанавливают когезин/CTCF-опосредованные петли хроматина.