Wolfram Research Mathematica

Mathematica 9.0 установлена в директорию /opt/shared/wolfram/mathematica/9.0

Ссылки на исполняемые файлы находятся в директории /opt/shared/wolfram/bin

Официальная документация от Wolfram Research: https://reference.wolfram.com/legacy/v9/guide/Mathematica.html

Запуск Mathematica должен происходить только на вычислительных узлах через планировщик PBS, но не на интерфейсном сервере.

Для работы с графическим интерфейсом используется интерактивный режим PBS, а также технология X window. После запуска задачи и получения доступа на узел кластера запуск графического пользовательского интерфейса производится следующей командой:

/opt/shared/wolfram/bin/Mathematica

Создать файл 'file.m', содержащий скрипт системы Mathematica:

Print /@ RandomVariate[MixtureDistribution[
    {1,2},
    {NormalDistribution[1,2/10],
    NormalDistribution[3,1/10]}],
    10,  WorkingPrecision -> 50]

Для его запуска с помощью PBS создать файл 'submit.sh' такого вида:

#!/bin/sh

#PBS -l walltime=0:10:00
#PBS -l select=1:ncpus=1:mem=2000m

cd $PBS_O_WORKDIR
/opt/shared/wolfram/bin/MathematicaScript -script file.m

Выполнить команду

qsub submit.sh

Результат будет сохранён в файле, соответствующем потоку стандартного вывода.

Создать 'file.m' :

Print /@ NIntegrate[x,{x,0,2}]

Для постановки в очередь использовать следующий 'submit.sh' :

#!/bin/sh

#PBS -l walltime=0:10:00
#PBS -l select=1:ncpus=1:mem=2000m

cd $PBS_O_WORKDIR
cat file.m | /opt/shared/wolfram/bin/MathKernel -noprompt