niboch_tetyugashev_202305-alkbh2-upd1.pdf

• Давлетгильдеева Анастасия Тимуровна, к.х.н., м.н.с., ИХБФМ СО РАН, руководитель;
• Тюгашев Тимофей Евгеньевич, в. инж., ИХБФМ СО РАН, исполнитель.
• Чжао Минсин, аспирант ИХБФМ СО РАН, исполнитель.

Посредством молекулярно-динамических расчетов в программном пакете GROMACS было выполнено моделирование диоксигеназы ALKBH2 человека дикого типа и её мутантных форм Y112A, I168A, D173A, R110A, R172A, E175A в комплексе с ДНК, содержащей 3-метилцитозин или 1-метиладенин. Результаты моделирования структуры фермент-субстратного комплекса, содержащего замены аминокислотных остатков в активном центре фермента позволяют, вместе с экспериментальными результатами, точнее охарактеризовать механизм действия фермента.

• РНФ № 21-14-00018 «Кинетические аспекты превращения фермент-субстратных комплексов в процессах деметилирования ДНК» Кузнецова А.А. 2020-2023

• Davletgildeeva, A., Tyugashev, T., Zhao, M., Kuznetsov, N., Ishchenko, A., Saparbaev, M., Kuznetsova, A., 2023. Individual Contributions of Amido Acid Residues Tyr122, Ile168, and Asp173 to the Activity and Substrate Specificity of Human DNA Dioxygenase ABH2. Cells 12, 1839. https://doi.org/10.3390/cells12141839
• В процессе подготовки две статьи, характеризующие мутантные формы V99A, F124A, S125A, R110A, R172A, E175A