, , ,

"Молекулярно-динамическое моделирование ДНК дуплекса с присоединенными тритильными радикалами". Евгений Дмитриевич Кадцын, специалитет ФЕН НГУ, 1.10.2017

nsu_edkadtseen_201709_tam.pdf

Аннотация

'С помощью полноатомной классичесской молекулярной динамики исследовалось влияние тритильных спиновых меток на конформационную динамику ДНК-дуплекса. Параметризация системы проводилась в пакете Amber, основное моделирование в пакете Gromacs 4.6. Исследовалась зависимость от времени расстояний между центрами радикалов и между концевыми пар оснований. На основе данных зависимостей были выделены три характерных типа конформаций системы. Из сравнения зависимостей для дуплекса с присоединенными радикалами и дуплекса без радикалов был сделан вывод, что наличие радикалов не оказывает принципиального влияния на конформационную динамику системы.'

Состав коллектива

Публикации