, , , ,

"Моделирование фолдинга белка виллина методом молекулярной динамики". Алексей Сергеевич Урсул, бакалавриат МедФ НГУ, 30.1.2017

nsu_asursul_201701.pdf

Состав коллектива

Постановка задачи

'На основе рассчитанных траекторий сворачивания белка виллина методами молекулярной динамики с образованием стабильных третичных структур, выполненных на суперкомпьютере НГУ, планируется провести анализ полученных состояний белка, и на основе сравнения по гомологии с третичными структурами известных белков из RCSB PDB (Protein Data Base) проверить метод поиска нативной структуры белка по его околонативному состоянию с использованием обширной базы гомологов. В рамках работы планируется выявить, имеется ли корреляция (и если да, то в какой степени) между первичной структурой белка (его аминокислотной последовательностью) и его полученной околонативной формой – промежуточной третичной формой, конфигурацию которой можно рассчитать на современных суперкомпьютерах.'