, , , ,

"Исследование роли пространственной организации генома в регуляции активности генов на примере локуса Pdgfra/Kit/Kdr, с использованием системы редактирования генома CRISPR/Cas9". Анастасия Сергеевна Рыжкова, ИЦиГ СО РАН, 28.04.2023

bionet_asryzhkova_202304.pdf

Состав коллектива

Аннотация

Гены локуса - Pdgfra, Kit и Kdr являются важными регуляторами развития, а нарушения их активности у человека связано с развитием ряда онкологических заболеваний. С помощью системы CRISPR/Cas9 были созданы несколько линий мышей, несущих различные делеции в локусе. Анализ последствий этих модификаций - на организменном уровне (анализ фенотипа), на уровне изменений пространственных контактов хроматина (capture Hi-C), а также на уровне активности генов (RNA-seq), позволил продемонстрировать тканеспецифичную роль 3D структуры генома в регуляции транскрипции генов локуса Kit.

Грантовая поддержка

Публикации