Пространственная организация геномов эукариот, включающая топологически-ассоциированные домены (ТАДы) и компартменты, консервативна, но механизмы их формирования могут различаться. У позвоночных одним из таких механизмов является экструзия петель хроматина с участием когезинового комплекса и белка-инсулятора CTCF. Однако у дрозофил, несмотря на наличие всех компонентов экструзионного комплекса, этот механизм отсутствует. В данном исследовании проведен эволюционный анализ структуры CTCF, выявивший разное время происхождения функциональных аминокислотных мотивов, и отобраны виды для экспериментов: мышь, курица, рыбка данио, дрозофила, скат, минога и ланцетник. Экспрессия CTCF мыши и курицы в клетках человека с деградированным эндогенным CTCF показала, что данные ортологи белка восстанавливают когезин/CTCF-опосредованные петли хроматина.