Кроме прочего, документация содержит ссылки на примеры, находящиеся на официальном сайте - см. главу 5 'INTRODUCTORY EXAMPLES'.
Существуют две версии программы - с возможностью распараллеливания (mpp) и без (serial). У нас они установлены, соответственно, в следующие директории:
Параметр '-d' обязательно должен присутствовать и указывать на директорию, находящуюся либо в домашней директории пользователя, либо в его рабочей области. Аналогично для файла, определяемого параметром '-o'.
Параметр '-W' является опциональным.
Описание возможных параметров находится в документации (см. раздел 2.1 'Options').